Novo método permite identificação mais precisa de linhas de arroz geneticamente editadas. Um grupo de pesquisadores apresentou o RiSpy, um framework que facilita a detecção de arroz geneticamente editado (GE).
O RiSpy é um framework de ponta que usa dados genéticos para identificar linhas de arroz geneticamente editado de maneira mais robusta, escalável e amplamente aplicável. O método foi desenvolvido pela Sciensano, em colaboração com CIRAD e parceiros do projeto DARWIN, junto com colegas da Universidade de Ghent.
Baseado em um conceito de impressão genética anterior, o RiSpy generaliza a abordagem em um framework de aprendizado de máquina capaz de distinguir múltiplas linhas de arroz. O método usa novas ferramentas de bioinformática e seleção de características estatísticas para gerar impressões genéticas mesmo para linhas de arroz geneticamente editado de cultivares não incluídas em bancos de dados públicos, como o 3K Rice Genomes database. Ele funciona com dados de sequenciamento de genoma de plataformas Illumina e Oxford Nanopore Technologies.
Os autores demonstraram a robustez, escalabilidade e especificidade do método usando duas linhas de arroz geneticamente editado de diferentes cultivares e conjuntos de dados públicos. Os resultados oferecem uma base metodológica para a tracabilização de arroz geneticamente editado, suportando a conformidade regulatória, a proteção de propriedade intelectual e a implementação responsável da legislação da UE sobre organismos modificados geneticamente e não-tradicionais.
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